После того, как Наруто лишился Курамы, Гаара транспортирует его и Сакуру к Минато, чтобы спасти Наруто путём переноса Инь-Курамы из Минато в Наруто. Сакура пытается ликвидировать последствия изъятия Курамы, но у неё ничего не выходит, и она прибегает к открытому массажу сердца Наруто. Между тем, обезумевшая Карин, пытаясь пробиться к Саскэ, противостоит Спиральному Дзэцу и миниатюрной версии Статуи Тысячи Рук.

Когда Мадара находится поблизости, Чёрный Дзэцу заявляет, что никто не может остановить его от сдачи риннэгана и Инь-Курамы. Когда Какаси и Гаара готовятся напасть на него, чтобы спасти Наруто, Чёрный Дзэцу оказывается не в состоянии оставить тело Обито.

Обито начинает вспоминать времена, когда он был ребёнком и пытался обогнать Какаси. После формирования новой команды Минато (Какаси, Рин, Обито) им начинают поручать мелкие миссии в деревне, но Обито с помощью дружбы с бабулями быстро выполняет их. Так их команда получает новое задание — миссия ранга С.

Минато и Обито прибыли помочь Какаси и Рин, но двое предателей уже сбежали. Раненый синоби сообщает, что им было дано два свитка. Он отдаёт Минато свой свиток, который оказывается фальшивкой. Какаси понимает, что настоящий свиток находится у синоби, упавшего с моста. Они отправляются спасти его.

Оротимару вместе с командой Така достигают Саскэ и обнаруживают рядом с ним Кабуто. Он объясняет, что благодаря Идзанами, осознал себя и решил спасти Саскэ. В это время, Гай атакует Мадару, открыв Седьмые Врата. Когда это не сработало, Гай понимает, что должен открыть Восьмые Врата, которые убьют его. Он вспоминает своё детство и отца, когда не поступив в Академию, решает пробежать 500 кругов, чтобы его приняли в качестве исключения.

Молодой Гай спрашивает отца, как тот может оставаться оптимистичным и не обращать внимания на критику со стороны других жителей. Дай говорит, что настоящая победа заключается не в победе над кем-то сильным, а в желании защищать то, что дорого. Хирудзэн решает принять Гая в Академию.

Гай атакует Мадару Вечерним Слоном, но останавливается, испытывая невыносимую боль из-за применения Восьмых Врат. Для поддержки Гая, Минато быстро разрабатывает план. Наконец Гай наносит пять мощнейших атак Вечерним Слоном. Мадара говорит, что не испытывал такого восторга со времён битвы с Хасирамой.

Хагоромо спрашивает Наруто, догадался ли он, кто является текущим воплощением Индры. Наруто отвечает, что это Саскэ. В это же время Хагоромо разговаривает с Саскэ. Мудрец говорит, что Саскэ — воплощение Индры и задаёт тот же вопрос о воплощении Асюры.

Вместе с 423 серией — специальный выпуск, посвящённый выходу в прокат 11-го по счёту анимационного фильма Наруто, «Наруто: Боруто».

После провала миссии по спасению Саскэ, Наруто учится использовать Стихию Ветра, а Конохамару успешно завершает второй этап тренировки. Наруто хотел приступить к третьему этапу, но выясняется, что Конохамару не умеет делать теневых клонов. Конохамару бросает Наруто вызов, кто же из них первым овладеет новой техникой.

Мадара удивлён, что Наруто остановил разрушение тела Гая. Он также чувствует, что сила Наруто увеличилась. Наруто, с помощью чакры Сон Гоку, создаёт Лавовый Расэнсюрикэн и атакует Мадару. Расэнсюрикэн срубает Божественное древо, а Мадара, повинуясь странному внутреннему голосу, поглощает Древо.

Обито спасает Сакуру, перенеся её в реальный мир. Мадара рассказывает Обито, что всегда контролировал его и даже подстроил смерть Рин, чтобы поселить ненависть в сердце Обито и склонить на свою сторону. Запечатав клона Мадары, Наруто, используя печать Ян на своей руке, восстанавливает глаз Какаси.

Мадара активировал Бесконечное Цукуёми, отразив риннэ сяринган на поверхности Луны. Яркий свет прерывает битву между Спиральным Дзэцу и Альянсом синоби. Каждое существо на планете попадает в гэндзюцу, кроме команды № 7, спасшихся с помощью Сусаноо Саскэ, и возрождённых Хокагэ.

Вместе с 428 серией — специальный выпуск «Путь Тэн-Тэн ~В мире снов~», действие которого происходит во вселенной 9-го по счёту анимационного фильма Наруто, «Наруто: Путь ниндзя».

Тэн-Тэн по наводке незнакомца пытается найти помощь в Скрытом Дожде, но на выходе из деревни её ловят. Оказывается, незнакомец — шпион Дождя, подставивший Тэн-Тэн, но её имя вскоре очищает Мэнма.

Показана мечта Киллера Би. Он вместе с Югито и их Хвостатыми, которые сидят у них на плечах и могут сражаться отдельно, освобождают сначала Гаару, а потом Наруто из темниц своих деревень для важной миссии — защиты некой принцессы от армии Акацуки.

В процессе боя Итати, узнав об уходе Саскэ к Оротимару, заявляет, что уходит из Акацуки вслед за Нагато. На помощь дзинтюрики приходит Фу, а после присоединяется к остальным. Вместе они находят Роси, в деревне которого пропадают дети. Как после выяснилось, это дело рук Оротимару, Кабуто и Саскэ.

Показаны прошлое и мечта Карин. Вместе с матерью она жила в Скрытой Траве, но мать использовали исключительно как лечебную чакру, в конце концов она погибла, когда много раненых синоби высосали для лечения всю её чакру. Её место заняла маленькая Карин, которая стала бояться той же участи.

Показана другая история, описанная в романе Дзирайи. Цунадэ открывает рукопись, которую Саннин только что закончил. После нападения Девятихвостого Кусина и Минато остались живы, Наруто стал дзинтюрики, а Утиха и Сэндзю заключили перемирие. По приказу Четвёртого Хокагэ все гэнины были отправлены на миссию S-ранга.

Миссия началась, поэтому все гэнины отправляются в путь вместе с сопровождающими их дзёнинами, но внезапно все сэнсэи таинственным образом пропадают, лишь команда Гая засекла нити чакры под землёй.

Cикамару, Ино и Тёдзи вступают в бой с Яхико, Конан и Нагато. Акацуки представляются командой Дзирайи, всячески нахваливая своего наставника, и сообщают о своих благих намерениях. Команда Дзирайи теснит гэнинов Конохи в лес, к самой деревне, которая оказывается совсем необитаемой.

Саскэ, Сакура, Наруто, Тэн-Тэн, Рок Ли и Нэдзи добрались до пустой деревни, чтобы объединиться с остальными, но столкнулись с мощной техникой, которая приняла вид сферы. Ребята остановились для наблюдения. Сикамару, Ино и Тёдзи решили пойти дальше, оставив спасение детей на Акацуки.

Незнакомец говорит, что знает многое о Конохе, даже больше, чем любой из ныне живущих. Незнакомец называет Нэдзи по имени и предлагает идти с ним, если он хочет знать правду о Конохе. Нагато, Яхико, Конан и команда Асумы спасают детей и отводят их домой.

Цунадэ продолжает читать рукопись Дзирайи. К ней подходит Сидзунэ и предлагает поужинать.

Сакура наносит удар по Сасори, после чего он отступает. Затем Сакура полностью извлекает яд из тела Саскэ и начинает его лечить. Дзирайя восстанавливает тэнкэцу Наруто и предлагает ему ослабить печать Кюби. Ли и Тэн-Тэн, убегая от атак преследовавшего их врага, встретились с командами Асумы и Курэнай.

Дзирайя сражается против четырёххвостого Наруто-Лиса. Он сильно ранит Дзирайю, ломая ему несколько рёбер. Саскэ нападает на марионеток Сасори, понимая что справиться будет не просто. Гэнины Скрытой Листвы присоединяются к бою, чтобы защитить Саскэ, но Сасори призывает ещё больше кукол, дабы показать синоби настоящий ад.

Нэдзи возвращается к своим друзьям и рассказывает, что всё это было экспериментом для них. Человек в маске распускает команду наёмников и просит команду Дзирайи (Нагато, Яхико и Конан) помочь эвакуировавшимся сельчанам вернуться в свои дома.

Цунадэ жалуется на плохое окончание рассказа Дзирайи. Сидзунэ приносит ей завтрак и Цунадэ начинает читать вторую часть.

Саскэ продолжает осваивать Тидори. Сакура принесла ему еду, но он отбрасывает её. Тогда вступается Наруто, после чего начинается бой, который останавливает Четвёртый Хокагэ. В разговоре со своим отцом Саскэ заявляет, что собирается идти по собственному пути.

Отряд Полиции Конохи во главе с Саскэ жестоко расправляется с нарушителями, из-за чего местное население начинает бояться их агрессивных методов. Наруто возвращается в Деревню Скрытой Листвы и замечает, что улицы и лавки опустели. Он сталкивается с Саскэ, но их прерывает Дандзо.