Прошло семь месяцев после того, как и Бреннан и Бут покинули страну, а Энджела и Ходжинс улетели в Париж. Кэролайн перезванивает им по поводу проблем в Джефферсонском Университете. Доктор Сароян оказывается на грани увольнения. Чтобы помочь ей в опознании детских останков, Джулиан собирает команду Бреннан в Вашингтоне. Из Афганистана прилетает Бут, встретивший там любовь, а у Энджелы неожиданные новости для Ходжинса.

В пещере находят обнявшиеся трупы. Судя по портрету, сделанному Анджелой, один из них— Джордж Клуни. Тем временем, из Афганистана прибывает Ханна Берли— новая любовь агента Сили Бута.

На пляже найден труп, разлагающийся прямо на глазах. Жертва была участником популярного американского реалити-шоу. Пока идет расследование, Бут предлагает Ханне жить с ним, а Анджела безуспешно пытается скрыть от всех свою беременность.

Помимо следствия о смерти охотника за преступниками, команде приходится иметь дело с экстравагантным телеведущим, готовым на все, чтобы заполучить Бреннан в свою передачу.

Убить многообещающего молодого танцора могли очень и очень многие— доброжелателей у него не было. Однако, раскрыть преступление мешает отсутствие костей— практически все они уничтожены редким грибком. Сохранились лишь полости в бетоне, которым был залит труп… Получая материал для новой статьи, Ханна попадает в больницу...

Во время идентификации погибших на перевозившем рабов судне Амелия Роуз, которое затонуло 150 лет назад, найдено тело юноши, убитого недавно. В ходе расследования Буту и Бреннан приходится посетить «круиз пумы», где женщины в возрасте проводят время с молодыми парнями. Тем временем Кэм обнаруживает личную связь с одной из жертв Амелии Роуз, а Свитс понимает, что платонических отношений с Дейзи ему недостаточно.

В самой большой в мире плитке шоколада обнаружен труп. Команда отправляется на шоколадную фабрику. Тем временем у Кэм и ее приемной дочери возникают разногласия по поводу выбора колледжа.

В сгоревшем грузовике найден расплавленный скелет. Расследование приводит Бута и Бреннан в местную школу. Возможно, разгадка кроется в запретной связи между учителем и учеником. Тем временем Ханна пытается наладить отношения с Паркером, а Свитс помогает Дейзи подготовиться к психологическому тестированию.

В ходе расследования таинственной смерти женщины-хирурга знаменитая объективность Бреннан подвергается серьёзному испытанию. Открывая новые улики, Бреннан находит все больше и больше сходства между собой и жертвой. Это заставляет ее задуматься над некоторыми своими поступками.

В ходе расследования дела о трупе, найденном в душе, выявляется связь с торговлей поддельными сумками. Тем временем Ходжинс и Анджела принимают важное решение об их дальнейшей семейной жизни, а Бут рассказывает Ханне о чувствах Бреннан к нему.

В тот момент, когда знаменитый убийца Могильщик должен отправиться на казнь, в него внезапно стреляют и убивают. Бут и Бреннан должны узнать кто же совершил это убийство. В ходе расследования становится известно, что выстрел совершил очень опытный снайпер, знакомый Бута.

Доктор Сароян только собралась пообедать со своим другом, как у его пациентки начались роды, а ей на телефон поступил звонок. В бескрайних просторах кукурузного поля обнаружен труп фермера. Заключение экспертов: отравлен, а потом застрелен одной из его трёх жён...

Останки велосипедиста были найдены на крыше склада. Свитс просит у Бута совета. Бут планирует доказать свою приверженность Ханне не словом, а делом.

Когда в солярии находят жидкие останки организатора свадеб, Кем давит на команду, чтоб они работали быстрее, чтобы она могла провести время со своим парнем. Кларк помогает Ходжинсу организовать самый лучший подарок для Анджелы.

После успешного убийства могильщицы, снайпер Джейкоб Бродски наносит ещё один удар, убив потенциального подозреваемого, который избежал правосудия. Бут использует свою военную подготовку, чтобы попытаться остановить Джейкоба. Отец Анджелы приезжает в Джефферсон и предлагает свое имя для будущего внука.

Во время метели, которая вызывает общегородской сбой в электроснабжении, команда должна раскрыть дело об убийстве, которое может быть связано с возможной вирусной вспышкой конго-крымской геморрагической лихорадки (ККГЛ). Бут и Бреннан оказались в ловушке внутри лифта во время отключения электроэнергии, а Свитс снаружи пытается завести разговор об отношениях Бута и Бреннан. Между тем, Анджела и Ходжинс получают тревожные новости, которые могут повлиять на здоровье их ребенка.

После наводнения на границе США и Канады, обнаружены восемь пар отсеченных ног, при этом семь пар принадлежат трупам с близлежащей «фермы тел». Бреннан предстоит работать с канадским судебным ортопедом доктором Дугласом Филмором. Между тем, Кэм продолжает строить планы насчет колледжа для своей дочери.

Знаменитый телеведущий, занимающийся опровержением мифов, найден убитым. Все следы указывают на то, что его убил Чупакабра...

Стеклянный глаз помогает установить жертву убийства, которого убили, чтобы завладеть картой сокровищ. Чтобы отыскать ее, а также убийцу, Бут и Бреннан сотрудничают с Уолтером, человеком, который может отыскать все, что угодно.

Мальчик, подглядывающий за женщинами в душе, случайно падает в клумбу и находит труп мужчины, состоящего в клубе честных людей. В это время Энджела злится на Ходженса, который ухаживает за ней настолько навязчиво, вплоть до ежедневной шнуровки ее туфель. А Венделл принимает слишком близко к сердцу доктрину говорить всегда правду.

На улице найдена глухонемая 15-летняя девушка, перепачканная кровью, с ножом в руках. Команда полагает, что девушка ответственна за недавнее убийство. Тем временем Анжела держит Ходжинса в неведении относительно некоторых деталей ее беременности.

Брэннан и Джефферсоновский молодой специалист Винсент Найджел-Мюррей исследует останки последней жертвы Джейкоба— «снайпера на свободе» Бродски. А между тем Бут и его помощникспециальный агент Дженни Шоу, полны решимости поймать Джейкоба.

Команда идентифицирует ужасные останки игрока в боулинг, которые были найдены застрявшими в одном из автоматических пинспоттеров. После того, как дело зашло в тупик, Бут и Бреннан решают под прикрытием найти улики, вступив в соперничающую команду по боулингу.