Комиссар Лоуб намерен окончательно выжить Джима из участка, и ему это удается. После очередного проступка офицер Гордон становится просто «мистером Гордоном». Джим не готов смириться с такой несправедливостью и отправляется к Пингвину, чтобы тот помог ему вернуть должность. Но Пингвин ничего не делает просто так... Между тем на политической сцене Готэма появляется новый игрок — миллиардер Тео Галаван, который сразу наводит шороху.

Тео убеждает мэра Готэма покинуть город. Это становится очередным шагом Галавана на пути к его цели — «очистить» Готэм пламенем и кровью. Следующий ход — нападение группы освобожденных из Аркхема преступников, которые назвались «Маньяками». Полиция города во главе с комиссаром Эссен и детективом Гордоном направляет все ресурсы на поимку новой преступной группировки.

Тео Галаван переходит к финальной части своего плана по завоеванию города. С помощью Джерома и Барбары он устраивает инсценировку на благотворительном приеме детской больницы, после которой Тео должен стать героем Готэма. Но его планам спешат помешать Джим Гордон, Брюс Уэйн и Альфред Пенниуорт.

Вырвавшаяся из Аркхэма шайка маньяков угрожает покою не только мирных жителей города, но и менее благонадежных граждан. Преступная империя Освальда страдает от беспорядков не меньше, чем остальной Готэм, и он намерен разобраться, кто же организовал столь дерзкий побег. Тем временем у полиции Готэма новый начальник — Натаниэль Барнс. Он намерен избавиться от коррупции и навести порядок вначале в самой полиции, а потом и во всем городе. Джим Гордон восхищен идеалами этого человека и полон желания ему помочь, но Харви не разделяет его энтузиазма — идеалисты в Готэме редко живут долго.

Ударный отряд под руководством Джима Гордона вовсю работает над разрушением империи Пингвина. А Тео тем временем поручает Пингвину работу: за ночь сжечь в городе пять зданий. У Бутча на примете как раз есть парочка профессиональных поджигателей. Полиции удается установить, что все здания принадлежат компании «Уэйн Энтерпрайз», но мотивы поджигателя оказываются скрыты куда глубже, чем может себе представить Джим Гордон.

Селина решает помочь Бридж уехать из города, а главное — успокоить ее прежде, чем та сойдет с ума. Джим Гордон продолжает поиски неизвестной поджигательницы и узнает, что ей помогает Селина. Бутч втирается в доверие к Тео Галавану и пытается разузнать местонахождение матери Освальда. Отношения Эдварда Нигмы и Кристин становятся все серьезнее, и он решает рассказать ей побольше о себе. Брюс Уэйн идет на первое в своей жизни свидание.

С помощью Бутча Тео Галаван заманивает Освальда на портовый склад и угрожает убить его вместе с матерью. Гертруда погибает, но Пингвину удается сбежать. Теперь он переполнен жаждой мести и твердо намерен расправиться с переметнувшимся помощником и новоявленным мэром Готэма. Интриганка Сильвер пытается окончательно подчинить себе Брюса и отвадить от него старую подругу. Джима Гордона одолевают сомнения насчет личности Тео. Нигма поспешно заметает следы убийства Кристин.

Замысел Тео Галавана подходит к ключевой стадии — он собирается обменять долю Брюса Уэйна в компании его родителей на информацию об их убийце. Но Джим Гордон уже понял, что Галаван не такой добряк, каким кажется, и, чтобы его отвлечь, Тео наконец позволяет Барбаре поразвлечься. А пока Джим, Харви и куча полицейских следуют по ее безумным указаниям в ловушку, надеясь узнать хоть что-то о замысле Галавана, далеко-далеко, в тихом лесу, Эдвард Нигма закапывает сундук со своей возлюбленной.

Раздосадованная неудачей брата Табита полна жажды отомстить инспектору Гордону и решает натравить на него наемных убийц. Джиму удается одолеть нападавшего, но тот объясняет, что его наниматель следует простому правилу: если первый сотрудник потерпел неудачу, попытки не прекратятся до успешного выполнения заказа. А Эдвард Нигма выхаживает Освальда и между делом рассказывает ему о последнем уроке, который он вынес из своей жизни.

Приближается слушание дела Тео Галавана. Хотя доказательства обвинения кажутся неоспоримыми, Джим беспокоится, что Тео удастся каким-то образом выйти сухим из воды. Тем временем Харви выясняет, что религиозная символика в квартире Тео принадлежит некоему Ордена святого Дюма. На днях несколько человек были заколоты таинственными людьми в рясах, и напарники подозревают, что все убийства как-то связаны с религиозным культом и Галаваном. Тем временем Брюс продолжает попытки узнать имя убийцы своих родителей и решает подойти к проблеме с другой стороны.

Планы Тео близки к завершению: сын Готэма у него в руках, и жертвоприношение состоится со дня на день. А пока он решает дать своей племяннице шанс вернуть его доверие и загладить свою промашку. Для этого Сильвер должна влюбить в себя Брюса Уэйна — снова. Тем временем в полицейский участок приходит мистер Фокс и делает заявление о пропаже Брюса. Несмотря на очевидную причастность ко всему Тео Галавана, комиссар Барнс отказывается дать делу официальный ход. Фокс, Альфред и Харви Буллок решают действовать самостоятельно и, заручившись поддержкой Джима Гордона и армии Пингвина, отправляются дать новому мэру Готэма финальный бой.

Джим Гордон оправдан и восстановлен в звании, а над Готэмом нависла новая угроза. Виктор Фрайс — молодой ученый, отчаянно ищущий способ спасти смертельно больную жену. Но времени все меньше, и он решает заморозить любимую до тех пор, пока не найдет лечение. Однако сперва Виктору нужно опробовать технологию заморозки на менее дорогих его сердцу людях. Во время очередного похищения его задерживает патрульная, и, когда ее замороженное тело находит полиция, Джим и Харви принимаются за расследование. Тем временем полиции Готэма удается задержать Освальда Кобблпота, и комиссар Барнс намерен вытянуть из него всю правду о том, что же случилось в ночь убийства Тео Галавана.

Полиция задержала жену Виктора, Нору, и комиссар Барнс не сомневается, что Виктор придет ее вызволить. Однако Норе нужен больничный уход, и в участке ее держать нельзя. Барнс предлагает перевезти ее в Аркхэм, самую защищенную лечебницу в городе. Джим и Харви ждут нападения Виктора, а на другом этаже с порядками психиатрической клиники знакомится ее новый пациент — Освальд Кобблпот.

Джима и Лесли беспокоит судьба Кристин Крингл — ведь она даже не забрала последнюю зарплату. Эд говорит Джиму, что ничего не знает, но убежден, что Джим водит его за нос. Брюс Уэйн и Альфред отправляются на поиски Патрика Мэлоуна — убийцы родителей Брюса. Однако Альфред не подозревает, что у Брюса свой взгляд на то, как следует свести счеты с убийцей. Освальд Кобблпот, по словам доктора Стрейнджа, стремительно идет на поправку, но перед этим ему предстоит еще несколько сеансов терапии.

Эдвард Нигма всерьез озабочен сохранностью своей тайны и переходит от слов к действиям. Неизвестный преступник вначале устраивает кражу в городском музее, а затем взрыв на центральном вокзале. Идущий по следу Джим Гордон даже представить не может, куда этот след его приведет. Официально вменяемый Освальд Кобблпот решает порадовать своей справкой старых друзей, но почему-то не находит ни у кого признания; вместо этого он неожиданно обретает новую семью. Брюс Уэйн привыкает к уличной жизни вместе с Селиной и вспоминает все, чему его учил Альфред.

Не успел Джим Гордон привыкнуть к тюремной рутине, как надзиратель сообщает ему, что его переводят в крыло F — «Край света», как называют его другие заключенные. Говорят, что единственный путь оттуда — ногами вперед. Однако Харви не готов опускать руки и продолжает искать способы вызволить напарника: законные и не слишком. Тем временем Освальд по-настоящему сближается с нежданно найденным отцом, но остальные члены семейства Вандаль отнюдь не рады новообретенному родственнику: старый Элайджа вот-вот сыграет в ящик, и лишний претендент на наследство им совсем ни к чему.

Освальд глубоко потрясен смертью отца. Вскоре он понимает, что остальная семья Элайджи не особо опечалена его кончиной, и, более того, совсем не рада обществу Освальда. Сжалившись, мачеха решает оставить Освальда, поручив ему всю работу по дому. Джиму Гордону удается раздобыть запись телефонного звонка анонимного свидетеля, который его подставил. Чтобы очистить звук на записи, он обращается к одному из немногих друзей, которые, как он уверен, у него остались — к Эдварду Нигме. Очнувшуюся из комы Барбару Кин признают вменяемой и выпускают из Аркхэма.

Вернувшаяся Барбара предлагает Джиму начать все сначала, но он почему-то не рад подобной перспективе. Однако вскоре оказывается, что без ее помощи в расследовании дела Уэйнов Джиму не продвинуться. Тем временем начитавшийся информации в компьютере отца Брюс Уэйн тоже возвращается к поиску убийцы родителей: согласно отцовским записям, разгадка кроется в неизвестном месте под названием «Пайнвуд фармс».

После вокрешения Тео Галаван не может вспомнить, кто он, и доктор Стрейндж решает подарить своему подопытному новую личность. Он сообщает Тео, что тот является легендарным рыцарем Азраилом из Ордена Святого Дюма, и приказывает ему убить Джима Гордона.

Харви и Джим заявляются в Аркхэм, чтобы провести обыск, но доктор Стрейндж оказывается уже готовым к их визиту. После случившейся в участке трагедии детектив Буллок становится исполняющим обязанности капитана. Бутч и Освальд объединяются против общего врага. А Селину ждет неожиданная встреча в вентиляционных шахтах Аркхэма.

Селина пытается пробудить в Бриджит воспоминания о прошлой жизни, но ее подруга очень хорошо вжилась в роль Светлячка. Брюс рассказывает Джиму, что Селина заперта в Аркхэме, и они вместе отправляются туда в компании мистера Фокса.

Стрейндж берет Джима в заложники и отправляет в участок к Буллоку своего подопечного, который способен превращаться в других людей. Нигма устраивает для Брюса и Люциуса смертельную викторину. Тем временем Фиш тоже ищет способ сбежать из Аркхэма.