Стараниями верных дому Медичи людей Орсини удается укрыться во дворце, откуда та пытается организовать сопротивление Пацци и остальным захватчикам. Риарио, тем временем, выпытывает у Лукреции возможное местонахождение Да Винчи, однако одержимость мужчины преследованием художника не находит понимания у его окружения. Леонардо же, в попытках спасти Лоренцо, решает использовать описанный арабским ученым новаторский метод, в ходе чего его посещает видение. В это же время Нико и Зо попадают в ловушку недавнего противника, имеющего на одного из них далеко идущие планы.

Не в силах подтвердить, что ее супруг жив, Орсини вскоре узнает о еще одной проблеме помимо Пацци, настраивающего горожан против Медичи. Да Винчи, тем временем, организует для Лоренцо возможность прилюдно выступить перед народом, после чего решает вернуться к своей главной миссии с помощью плутоватого знакомого. Между тем Папа заручается поддержкой короля Неаполя, чтобы завладеть Флоренцией, Ванесса начинает жить при дворце, а Леонардо встречает, казалось бы, погибшую возлюбленную и получает ценный подарок.

Король Ферранте, Урбина и Папа заключают соглашение, направленное против Медичи, тем самым понижая шансы Флоренции найти достойных союзников. Чтобы разрешить ситуацию, Лоренцо готовится нанести личный визит Сиксту, оставив Орсини замещать его в важных вопросах. После провала обманного маневра по завладению одним из кораблей, Леонардо, вдохновленный морскими обитателями с рыбного рынка, изобретает невиданное ранее устройство, позволяющее ему с Зо незаметно добраться до нужного им судна и провернуть операцию по его захвату. Меркури же решает проверить любопытную информацию, которая открывает ему ужасную правду.

Освободив рабов, Да Винчи старается убедить их, что земля круглая и им ничего не угрожает, а также использует все возможности, чтобы найти путь к своей цели. В это же время Риарио в надежде отыскать местоположение книги жизни пытается склонить Нико на свою сторону, однако встречает от юноши достойный отпор. Между тем Лоренцо с Пьеро в процессе своего путешествия попадают в переделку, а Лукреция заручается помощью Меркури в попытках освободить отца из заключения.

Прибыв к неизведанным землям, Да Винчи с командой не только находят подсказки к нахождению книги жизни, но и встречаются с недружелюбно настроенными незнакомцами. Леонардо ждет смертельное испытание, встреча с верным другом и старым врагом, а также неожиданные вести о матери. Тем временем Лоренцо пытается использовать былые чувства к предмету своей первой любви для того, чтобы встретиться с королем Неаполя. Кларисса же заключает сделку с недавно объявившемся во Флоренции незаконным сыном Козимо ради удержания под контролем банковской системы.

Чтобы достичь заветной цели, Леонардо и Риарио приходится объединить усилия и пройти серьезные испытания, где один приоткроет завесу будущего, а второй навсегда попрощается с любимой. Между тем Лоренцо готовится выдержать проверку безумного правителя Неаполя и находит неожиданную поддержку в лице погибшего брата, в то время как Ипполита предлагает любимому альтернативное решение. Лукреция же в ходе своего путешествия встречается с Турком, предупреждающим женщину о страшном будущем человечества, которое нужно предотвратить.

Има соглашается отправиться под Небесный свод вместе со всеми выжившими пленниками, однако первое же испытание отрезает ее от Да Винчи и остальных. С помощью смекалки Леонардо успешно преодолевает все испытания, чтобы в конце, в шаге от несбыточной мечты, испытать предательство новой знакомой. Тем временем Лукреция встречается со старшим сыном турецкого султана Байезидом в надежде заключить сделку, а Карло предпринимает меры по устранению заказчика недавнего покушения на него, Клариссу и Ванессу.

Самоуверенным планам Байезида заключить мирный договор с Папой не суждено сбыться — при прибытии его ждет более чем прохладная встреча, в то время как Лукреция знакомится с советником султана, намеренным вызнать все ее тайны. Ипполита между тем делает все, чтобы Лоренцо заслужил уважение короля, но этого оказывается недостаточно в свете задуманного ее супругом противодействия Медичи. Да Винчи с соратниками же удается сбежать от Имы и ее армии, однако вместо книги Жизни Леонардо получает лишь очередную подсказку к ее местонахождению.

Возвратившись в родной город, Да Винчи оказывается свидетелем переворота, устроенного герцогом Урбино, но благодаря хитрости и новому изобретению художнику удается не только вырваться из плена, но и спасти Клариссу, Карло и своих друзей от расправы. Тем временем Лоренцо выдвигает королю заманчивое предложение, что идет вразрез с намерениями Папы, желающим любой ценой исправить сложившееся положение дел. Риарио же пытается найти свое место в жизни, а Лукреция подвергается изощренной пытке с целью узнать истинные намерения отца, пославшего ее ко двору султана.

Скорбя по наставнику, Леонардо пытается догнать его убийцу, но вместо этого, раненый, оказывается посреди леса, где его ждет встреча с Турком. Тот указывает художнику на иную интерпретацию подсказки матери, направляя Да Винчи в портовый город, куда в это же время прибывает Лукреция в качестве дипломата османской армии. Между тем, узнав о нанесенном Карло уроне, Орсини принимает нелегкое решение, в результате которого Ванесса неожиданно получает новый статус. Лео же придумывает способ, как дать отпор многочисленному турецкому войску, когда отец сообщает ему неожиданную новость.